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Thèse / CryHolo : « Apport de la Cryo-Holographie en microscopie électronique pour l’étude de la matière biologique »

Entreprise/Labo : CEMES / Toulouse

Description :

L'étudiant.e recruté.e rejoindra l'équipe « In situ, Interferometry and Instrumentation for Electron Microscopy » du CEMES-CNRS et l’équipe «Dynamique et Dysfonctionnements de la Synthèse des Ribosomes » du Laboratoire de Biologie Moléculaire Eucaryote du Centre de Biologie Intégrative (LBME/CBI) de l’Université Paul Sabatier de Toulouse. L'étudiant.e développera la technique d’holographie électronique pour l’imagerie à basse température de matériaux biologiques.

Activités

L'étudiant.e sera impliqué dans chaque étapes de ce projet :

  • La mise en place de l'expérience d'holographie électronique à basse température
  • La préparation des objets biologiques par les techniques de cryo-préparation
  • L’optimisation des codes de pilotage du microscope d’acquisition des hologrammes
  • Le traitement et l’analyse des hologrammes Chaque étape permettra au candidat.e d'acquérir des expertises en MET et dans les techniques associées et d'obtenir des résultats orignaux.

Compétences

Nous recherchons particulièrement un.e candidat.e avec des bases en matière condensée et/ou en biologie structurale. Une première expérience en microscopie électronique est la bienvenue.

Cadre

Ce travail se déroulera au sein de deux équipes :

  • l’équipe I3EM « In-situ, Interferometry and Instrumentation for Electron Microscopy » du CEMES et l’équipe « Dynamics and disorders of ribosome synthesis » au CBI. Ø Le groupe du CEMES développe de nouvelles méthodologies en MET pour l’étude quantitative de la physique des champs à l’échelle nanométrique. Ces champs peuvent être magnétiques, électriques, élastiques ou chimiques. Les travaux de cette équipe visent augmenter la sensibilité des mesures MET, minimiser leur bruit tout en améliorant la résolution spatiale. Ø
  • l’équipe du CBI s'intéresse aux mécanismes de la synthèse des ribosomes dans les cellules humaines sous plusieurs angles: traitement de l'ARN pré-ribosomal, exportation nucléaire de particules pré-ribosomiques, structure des pré-ribosomes. Les chercheurs utilisent la cryo-microscopie pour étudier le remodelage structurel des particules préribosomiques à différentes étapes de leur maturation qui est la principale technique disponible pour atteindre cet objectif.

L'étudiant.e sera financé.e par un projet Multidisciplinaire de l’Université Fédérale de Toulouse cofinancé par la région Occitanie et soutenu par la Mission pour les Initiatives Transverses et Interdisciplinaire du CNRS (MITI). Il.elle travaillera principalement au CEMES. Le CEMES est un laboratoire du CNRS, basé à Toulouse, axé sur la recherche fondamentale en science des matériaux, physique des solides et chimie moléculaire. Le CEMES est reconnu internationalement dans le domaine de la microscopie électronique en transmission (TEM), plus particulièrement pour ses développements instrumentaux autour du TEM. Parmi les 7 TEM disponibles au laboratoire, l'équipe I3EM travaille sur un microscope dédié à l'holographie électronique et aux expériences in-situ. Le laboratoire bénéficie aussi de tout le support technique requis avec un service d'aide à la préparation d'échantillons.



Contact : E. Snoeck DR -CEMES / CNRS, P.E. Gleizes Prof. CBI / UPS

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